唯心聖教應用易經研究所以易經、風水及宗教三大主軸為教育核心價值，學易經知因果，學風水創淨土，學佛學了生死，學道學明無為，學儒修寬恕，跨領域學習，全球唯一授予易經學碩士學位之研究所。
唯心聖教創教宗主混元禪師指出，他自從民國71年和本教教主王禪老祖師尊天人合一之後，就在證道與悟道間來回研究與探討，發現易經、風水及建築是息息相關，尤其在建築內包含庭園景觀，這是現代人最完美的生活空間。而人從無形無相的靈魂世界投胎到父母的家中，在成長的過程，都是受到環境和家庭的保護，即是易經風水學的保護，但人們都忽略了這道理的存在。所以混元禪師指出要將易經風水學與建築及庭園景觀結合，一以貫之，把它熔為一爐。同時混元禪師亦發現士農工商百業的經營決策的重要性，可為與不可為的決定，關乎百業的永續發展，以及在百業發展中如何安住民心？此即是在金剛般若波羅蜜經中須菩提長老向佛行禮問曰：「希有，世尊！如來善護念諸菩薩，善付囑諸菩薩，世尊，善男子、善女人，發阿耨多羅三藐 三菩提心，云何應住？云何降伏其心？」故試問在士農工商百業組織中若民心無法安定？組織、社會、國家、家庭、個體等如何永續發展？本唯心聖教教義是安心法門，混元禪師指出社會大眾可從易經八卦內涵去體悟如何達到安心之道，故需教導學生如何將易經、風水、宗教應用於百業的經營。
唯心聖教應用易經研究所是培育具宗教關懷，能於世間弘法利生，為士農工商百業創造永續發展經營的大智慧賢者之基地，為社會國家培育齊家、治事業、治國、平天下之賢者，使其於畢業之後，安邦定國成為社會國家之中流砥柱。唯心聖教應用易經研究所之核心價值是建構於唯心聖教之天命「防止世界之飢餓與貧窮而發生之戰爭」，以及本唯心聖教之核心法脈教義—「為國修道、為民祈福」，與追根溯源大孝法門、安心法門、利他法門、消災化劫法門、禮運大同法門等五大唯心聖教法門教義。希冀畢業生之大未來能成為國家政府或企業組織之佐國良相，創造安定祥和富足的社會國家，進而達到世界大同、天下太平之境。
